Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSMPQ1L6U9 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MSMPQ1L6U9 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.9 ms