Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ECM1Q16610 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ECM1Q16610 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
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