Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNRNP35Q16560 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNRNP35Q16560 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNRNP35Q16560 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.5 ms