Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKN1Q16512 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PKN1Q16512 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKN1Q16512 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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