Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ALX1Q15699 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ALX1Q15699 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
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