Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1CQ15572 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1CQ15572 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1CQ15572 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1CQ15572 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1CQ15572 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1CQ15572 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1CQ15572 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1CQ15572 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1CQ15572 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1CQ15572 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1CQ15572 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TAF1CQ15572 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TAF1CQ15572 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TAF1CQ15572 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.3 ms