Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CNN3Q15417 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNN3Q15417 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNN3Q15417 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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