Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms