Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCINQ13939 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCINQ13939 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCINQ13939 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCINQ13939 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CCINQ13939 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCINQ13939 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCINQ13939 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCINQ13939 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCINQ13939 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCINQ13939 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCINQ13939 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CCINQ13939 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCINQ13939 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCINQ13939 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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CCINQ13939 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCINQ13939 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCINQ13939 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCINQ13939 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCINQ13939 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCINQ13939 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCINQ13939 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCINQ13939 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCINQ13939 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCINQ13939 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CCINQ13939 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCINQ13939 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCINQ13939 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCINQ13939 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCINQ13939 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCINQ13939 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCINQ13939 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCINQ13939 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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CCINQ13939 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCINQ13939 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
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CCINQ13939 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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CCINQ13939 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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CCINQ13939 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCINQ13939 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCINQ13939 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCINQ13939 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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CCINQ13939 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
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CCINQ13939 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCINQ13939 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCINQ13939 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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CCINQ13939 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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CCINQ13939 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCINQ13939 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCINQ13939 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCINQ13939 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CCINQ13939 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCINQ13939 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCINQ13939 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCINQ13939 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCINQ13939 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCINQ13939 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CCINQ13939 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCINQ13939 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCINQ13939 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCINQ13939 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCINQ13939 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCINQ13939 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCINQ13939 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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