Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PKP1Q13835 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PKP1Q13835 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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