Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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SNX1Q13596 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNX1Q13596 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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SNX1Q13596 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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SNX1Q13596 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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SNX1Q13596 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNX1Q13596 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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SNX1Q13596 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNX1Q13596 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
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SNX1Q13596 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNX1Q13596 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNX1Q13596 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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SNX1Q13596 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
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