Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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