Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RIPK1Q13546 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RIPK1Q13546 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms