Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LSAMPQ13449 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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