Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ERCC8Q13216 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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ERCC8Q13216 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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ERCC8Q13216 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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ERCC8Q13216 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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ERCC8Q13216 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
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ERCC8Q13216 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ERCC8Q13216 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERCC8Q13216 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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