Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DUSP4Q13115 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DUSP4Q13115 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DUSP4Q13115 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
DUSP4Q13115 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP4Q13115 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP4Q13115 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms