Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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TRAF3Q13114 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAF3Q13114 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAF3Q13114 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAF3Q13114 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAF3Q13114 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
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TRAF3Q13114 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF3Q13114 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF3Q13114 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF3Q13114 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF3Q13114 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF3Q13114 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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TRAF3Q13114 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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TRAF3Q13114 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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TRAF3Q13114 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAF3Q13114 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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TRAF3Q13114 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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TRAF3Q13114 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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TRAF3Q13114 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
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TRAF3Q13114 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
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TRAF3Q13114 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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TRAF3Q13114 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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TRAF3Q13114 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF3Q13114 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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