Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAF2Q12933 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF2Q12933 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.2 ms