Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
BPTFQ12830 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-2.62□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-2.63□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
BPTFQ12830 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.5 ms