Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
EFEMP1Q12805 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
EFEMP1Q12805 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EFEMP1Q12805 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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