Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RABGGTBP53611 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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