Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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ERVV-2B6SEH9 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
ERVV-2B6SEH9 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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