Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-2.52□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CDC42SE2Q9NRR3 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms