Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITRM1Q5JRX3 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITRM1Q5JRX3 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITRM1Q5JRX3 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITRM1Q5JRX3 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITRM1Q5JRX3 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PITRM1Q5JRX3 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PITRM1Q5JRX3 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PITRM1Q5JRX3 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PITRM1Q5JRX3 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PITRM1Q5JRX3 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PITRM1Q5JRX3 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PITRM1Q5JRX3 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PITRM1Q5JRX3 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PITRM1Q5JRX3 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PITRM1Q5JRX3 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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