Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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SSX1Q16384 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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SSX1Q16384 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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SSX1Q16384 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
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SSX1Q16384 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
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SSX1Q16384 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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SSX1Q16384 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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SSX1Q16384 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
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SSX1Q16384 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SSX1Q16384 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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