Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
USF2Q15853 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
USF2Q15853 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
USF2Q15853 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
USF2Q15853 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
USF2Q15853 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
USF2Q15853 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
USF2Q15853 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
USF2Q15853 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
USF2Q15853 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
USF2Q15853 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
USF2Q15853 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
USF2Q15853 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
USF2Q15853 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
USF2Q15853 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
USF2Q15853 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
USF2Q15853 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
USF2Q15853 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
USF2Q15853 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
USF2Q15853 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
USF2Q15853 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
USF2Q15853 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
USF2Q15853 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
USF2Q15853 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
USF2Q15853 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
USF2Q15853 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
USF2Q15853 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
USF2Q15853 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
USF2Q15853 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
USF2Q15853 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
USF2Q15853 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
USF2Q15853 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
USF2Q15853 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
USF2Q15853 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
USF2Q15853 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
USF2Q15853 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
USF2Q15853 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
USF2Q15853 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
USF2Q15853 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
USF2Q15853 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
USF2Q15853 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
USF2Q15853 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
USF2Q15853 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
USF2Q15853 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
USF2Q15853 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
USF2Q15853 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
USF2Q15853 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
USF2Q15853 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
USF2Q15853 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
USF2Q15853 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
USF2Q15853 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
USF2Q15853 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
USF2Q15853 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
USF2Q15853 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
USF2Q15853 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
USF2Q15853 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms