Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC85BQ15834 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC85BQ15834 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC85BQ15834 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms