Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TGIF1Q15583 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TGIF1Q15583 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TGIF1Q15583 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TGIF1Q15583 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TGIF1Q15583 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TGIF1Q15583 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TGIF1Q15583 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TGIF1Q15583 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TGIF1Q15583 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TGIF1Q15583 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms