Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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NR1I3Q14994 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
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NR1I3Q14994 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
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NR1I3Q14994 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NR1I3Q14994 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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NR1I3Q14994 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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NR1I3Q14994 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1I3Q14994 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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