Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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COL19A1Q14993 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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COL19A1Q14993 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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COL19A1Q14993 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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COL19A1Q14993 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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COL19A1Q14993 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COL19A1Q14993 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
COL19A1Q14993 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL19A1Q14993 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL19A1Q14993 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL19A1Q14993 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL19A1Q14993 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL19A1Q14993 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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COL19A1Q14993 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COL19A1Q14993 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
COL19A1Q14993 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COL19A1Q14993 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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COL19A1Q14993 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL19A1Q14993 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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