Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
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UBE4AQ14139 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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UBE4AQ14139 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
UBE4AQ14139 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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