Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDE6HQ13956 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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