Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCINQ13939 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCINQ13939 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCINQ13939 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCINQ13939 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCINQ13939 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCINQ13939 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCINQ13939 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCINQ13939 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCINQ13939 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCINQ13939 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCINQ13939 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCINQ13939 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCINQ13939 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCINQ13939 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCINQ13939 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCINQ13939 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCINQ13939 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCINQ13939 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCINQ13939 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCINQ13939 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCINQ13939 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCINQ13939 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCINQ13939 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCINQ13939 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CCINQ13939 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CCINQ13939 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CCINQ13939 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCINQ13939 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCINQ13939 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCINQ13939 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCINQ13939 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCINQ13939 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCINQ13939 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCINQ13939 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCINQ13939 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCINQ13939 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCINQ13939 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCINQ13939 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCINQ13939 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCINQ13939 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCINQ13939 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCINQ13939 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCINQ13939 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCINQ13939 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCINQ13939 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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