Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1SQ13698 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CACNA1SQ13698 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms