Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PEX6Q13608 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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