Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUBB3Q13509 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUBB3Q13509 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUBB3Q13509 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUBB3Q13509 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUBB3Q13509 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TUBB3Q13509 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBB3Q13509 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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TUBB3Q13509 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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TUBB3Q13509 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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TUBB3Q13509 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBB3Q13509 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBB3Q13509 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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TUBB3Q13509 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TUBB3Q13509 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TUBB3Q13509 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBB3Q13509 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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