Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TUSC3Q13454 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TUSC3Q13454 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms