Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LSAMPQ13449 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LSAMPQ13449 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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