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Protein–RNA interactions for Protein: Q13068
GAGE4, G antigen 4, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
GAGE4
Q13068
RNU6-919P-201
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104 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
AC007991.2-201
ENST00000520185
102 nt
TSL 5
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
RNU7-10P-201
ENST00000607194
63 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
AC012531.4-201
ENST00000616509
177 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
Y_RNA.173-201
ENST00000363776
113 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
RNU6-1229P-201
ENST00000364295
107 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
RNU6-392P-201
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101 nt
BASIC
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□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
RNU6-110P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
MIR532-201
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91 nt
BASIC
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□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
AL162399.1-201
ENST00000426090
130 nt
TSL 3
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
Y_RNA.809-201
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95 nt
BASIC
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□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
RNA5SP94-201
ENST00000516917
108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.31
GAGE4
Q13068
Y_RNA.338-201
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114 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
MIR181B2-201
ENST00000385004
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BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
AL161932.1-201
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146 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
AC244669.1-204
ENST00000621564
178 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
MIR6866-201
ENST00000638146
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BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNA5SP432-201
ENST00000362480
116 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
Y_RNA.95-201
ENST00000363079
95 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
SNORD45B-201
ENST00000364617
72 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNA5SP517-201
ENST00000364724
117 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU6-716P-201
ENST00000365621
103 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU6-524P-201
ENST00000384270
107 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
AL031737.1-201
ENST00000450125
223 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU7-104P-201
ENST00000459398
79 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU6-904P-201
ENST00000516206
101 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
SNORA25.18-201
ENST00000607153
114 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
MIR6857-201
ENST00000613267
93 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
AC092634.7-201
ENST00000621022
103 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
Y_RNA.10-201
ENST00000362371
110 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
SNORA36.1-201
ENST00000363424
132 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU6-945P-201
ENST00000383947
107 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
SNORD28-201
ENST00000384706
75 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU6ATAC27P-201
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119 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
Y_RNA.601-201
ENST00000410500
113 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
AC244505.6-201
ENST00000452829
130 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
SCARNA23-201
ENST00000516060
130 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU6-351P-201
ENST00000516097
100 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
MIR4498-201
ENST00000577599
66 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
ZBTB41-201
ENST00000367405
8478 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU6-1244P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU4-45P-201
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141 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU6-243P-201
ENST00000391140
107 nt
BASIC
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GAGE4
Q13068
AC097635.1-201
ENST00000450678
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BASIC
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GAGE4
Q13068
RNU7-161P-201
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62 nt
BASIC
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GAGE4
Q13068
MIR3973-201
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GAGE4
Q13068
MIR4777-201
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BASIC
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GAGE4
Q13068
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BASIC
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GAGE4
Q13068
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BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
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ENST00000620525
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BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
AC025521.1-201
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286 nt
BASIC
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GAGE4
Q13068
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BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
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BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU6-321P-201
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BASIC
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GAGE4
Q13068
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BASIC
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GAGE4
Q13068
RNU4-54P-201
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BASIC
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GAGE4
Q13068
RNA5SP268-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNA5SP47-201
ENST00000517230
109 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
VPS35-212
ENST00000640313
141 nt
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU6-766P-201
ENST00000362478
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BASIC
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□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
RNU6-1113P-201
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BASIC
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GAGE4
Q13068
RNU6-644P-201
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BASIC
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GAGE4
Q13068
RNU6-1053P-201
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BASIC
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GAGE4
Q13068
RNU6-162P-201
ENST00000516228
103 nt
BASIC
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GAGE4
Q13068
MIR4639-201
ENST00000584938
69 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
GAGE4
Q13068
SNORD36A-201
ENST00000362874
73 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
Y_RNA.78-201
ENST00000362970
110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU6-1125P-201
ENST00000363601
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU6-480P-201
ENST00000384332
107 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
SNORA8.2-201
ENST00000384372
139 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU6-813P-201
ENST00000384691
107 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
snoU13.11-201
ENST00000459219
104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU7-61P-201
ENST00000515897
61 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU6-237P-201
ENST00000515985
71 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
SCARNA16.5-201
ENST00000517114
183 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU6-537P-201
ENST00000517277
103 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU6-1260P-201
ENST00000362944
107 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU6-147P-201
ENST00000383983
107 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU6-135P-201
ENST00000516769
101 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
AL513043.2-201
ENST00000573941
143 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
Y_RNA.107-201
ENST00000363190
121 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNY1P10-201
ENST00000363268
113 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU6-957P-201
ENST00000363652
99 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNA5SP102-201
ENST00000516865
106 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
MIR7107-201
ENST00000611489
80 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
ST7-OT3_3.1-201
ENST00000611709
115 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
uc_338.17-201
ENST00000619633
179 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
MIR6835-201
ENST00000621552
64 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
HECTD2-202
ENST00000371667
4354 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
MIR337-201
ENST00000362281
93 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNA5SP403-201
ENST00000363598
108 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU6-755P-201
ENST00000364400
103 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
MIR519A1-201
ENST00000385257
85 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
SNORA40.8-201
ENST00000411034
126 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
SNORD71-201
ENST00000411292
86 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
AL603825.1-201
ENST00000438481
80 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
RNU4ATAC9P-201
ENST00000517146
126 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
AC087277.2-201
ENST00000533203
151 nt
TSL 5
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
TRDV1-202
ENST00000621643
102 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
GAGE4
Q13068
AC067863.3-201
ENST00000624172
122 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
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