Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GRIK2Q13002 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIK2Q13002 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.6 ms