Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
FOXO1Q12778 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
FOXO1Q12778 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
FOXO1Q12778 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.7 ms