Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXA4Q00056 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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