Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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PGGT1BP53609 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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PGGT1BP53609 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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PGGT1BP53609 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PGGT1BP53609 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PGGT1BP53609 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PGGT1BP53609 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PGGT1BP53609 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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PGGT1BP53609 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PGGT1BP53609 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PGGT1BP53609 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PGGT1BP53609 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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