Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TM4SF4P48230 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TM4SF4P48230 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms