Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRXP46100 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRXP46100 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRXP46100 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRXP46100 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRXP46100 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRXP46100 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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