Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TSPAN3O60637 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TSPAN3O60637 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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TSPAN3O60637 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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TSPAN3O60637 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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TSPAN3O60637 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPAN3O60637 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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TSPAN3O60637 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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TSPAN3O60637 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPAN3O60637 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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TSPAN3O60637 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPAN3O60637 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPAN3O60637 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPAN3O60637 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPAN3O60637 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPAN3O60637 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TSPAN3O60637 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN3O60637 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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