Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CRXO43186 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CRXO43186 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CRXO43186 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CRXO43186 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CRXO43186 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CRXO43186 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CRXO43186 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CRXO43186 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CRXO43186 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CRXO43186 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CRXO43186 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CRXO43186 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CRXO43186 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CRXO43186 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CRXO43186 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CRXO43186 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CRXO43186 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CRXO43186 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CRXO43186 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CRXO43186 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CRXO43186 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CRXO43186 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CRXO43186 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CRXO43186 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CRXO43186 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CRXO43186 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CRXO43186 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CRXO43186 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CRXO43186 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CRXO43186 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CRXO43186 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CRXO43186 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CRXO43186 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CRXO43186 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CRXO43186 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CRXO43186 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CRXO43186 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CRXO43186 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CRXO43186 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CRXO43186 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CRXO43186 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CRXO43186 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CRXO43186 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CRXO43186 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CRXO43186 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CRXO43186 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CRXO43186 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CRXO43186 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CRXO43186 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CRXO43186 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CRXO43186 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CRXO43186 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CRXO43186 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CRXO43186 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
CRXO43186 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms