Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PODXLO00592 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PODXLO00592 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PODXLO00592 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PODXLO00592 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PODXLO00592 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PODXLO00592 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PODXLO00592 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PODXLO00592 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PODXLO00592 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PODXLO00592 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PODXLO00592 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PODXLO00592 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PODXLO00592 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PODXLO00592 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PODXLO00592 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PODXLO00592 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PODXLO00592 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PODXLO00592 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PODXLO00592 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PODXLO00592 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PODXLO00592 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PODXLO00592 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PODXLO00592 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PODXLO00592 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PODXLO00592 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PODXLO00592 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PODXLO00592 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PODXLO00592 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PODXLO00592 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PODXLO00592 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PODXLO00592 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PODXLO00592 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PODXLO00592 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PODXLO00592 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PODXLO00592 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PODXLO00592 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PODXLO00592 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PODXLO00592 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PODXLO00592 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PODXLO00592 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PODXLO00592 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PODXLO00592 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PODXLO00592 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PODXLO00592 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PODXLO00592 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PODXLO00592 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PODXLO00592 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PODXLO00592 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PODXLO00592 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PODXLO00592 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PODXLO00592 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PODXLO00592 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PODXLO00592 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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