Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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SNX13Q9Y5W8 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX13Q9Y5W8 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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SNX13Q9Y5W8 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SNX13Q9Y5W8 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNX13Q9Y5W8 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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SNX13Q9Y5W8 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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