Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CIPCQ9C0C6 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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